SHK utreder olyckor och tillbud inom den civila sjöfarten sedan 1990. Transportstyrelsen är säkerhetsmyndighet och tillsynsmyndighet. SHK:s uppdrag omfattar utredningar av olyckor eller tillbud till sjöss som inträffar i direkt anslutning till driften av handelsfartyg, fiskefartyg eller statsfartyg.